建設項目的被審計單位是建設單位，施工單位只是被調查單位。但是，在審計結算的過程中，往往將施工單位作為被審計對象，由審計人員與施工人員核對。審計人員面臨各種壓力，甚至受到威脅。負責任的建設單位還會從中協調，不負責任的建設單位則會“溜邊”，由審計人員與施工人員直接“干仗”。
因此，投資審計在審計對象上，一定要把建設單位作為被審計單位，對發現的建設管理問題，要及時作審計取證記錄，要在審計報告中反映;要向建設單位講清楚，審計報告將發送哪些部門(市局投資審計報告一般抄送監察局、發改委、財政局及主管部門，必要時出具審計結果報告報政府)，給建設單位施加壓力，樹立審計的權威。在審計內容上，除了對工程結算情況進行審計外，要按《江西省審計條例》第十七條等的規定，對履行基本建設程序情況，資金來源、使用和管理情況，預算、概算執行和項目績效情況等進行審計。本文的審計案例，經審計人員反復說明利害關系，建設單位站到了審計這一邊，同意審計人員的觀點，答應做施工單位的工作。因此，施工單位只到審計局兩次，沒有再糾纏審計人員。
另外，要注意法律、法規的概念和實施時間的不同。《招標投標法》由全國人大頒布，是法律，從2000年1月1日起實施。《招標投標法實施條例》由國務院頒布，是法規，從2012年2月1日起實施。《招標投標法實施條例》是在《招標投標法》實施約12年后才頒布，因此《條例》認真總結《招標投標法》實施以來的實踐經驗，針對新情況、新問題充實完善有關規定，增強可操作性。審計人員在審計2012年2月1日以后招標的工程，審計報告引用法律法規時，建議引用《招標投標法實施條例》。